Исследование направлено на выявление РНК энтеровируса в кале. Возбудители энтеровирусных инфекций – это кишечные вирусы, размножающиеся в кишечнике и выделяющиеся из организма с фекалиями.  Род энтеровирусов объединяет полиовирусы, вирусы Коксаки, ECHO, которые вызывают целый спектр  различных заболеваний : полиомиелит , миокардит и перикардит , герпетическая ангина,  асептический серозный менингит, энцефалит, эпидемическая миалгия, эпидемический геморрагический конъюнктивит, энтеровирусная диарея. Источник инфекции - больной человек или вирусоноситель. Основной путь передачи вируса  фекально-оральный: водный и алиментарный.  Возбудитель проникает  в организм человека  через слизистую оболочку верхних дыхательных путей и пищеварительного тракта, где и происходит первичное накопление вируса.  Далее вирус попадает в лимфатические узлы, где так же продолжается его репликация, и на 3 день происходит поражение вирусом других органов, в том числе возможно и поражение ЦНС.  Учитывая  особенности инфицирования, наиболее информативными средами для диагностики энтеровирусной инфекции является отделяемое рото-носоглотки, кал, и ликвор.  Поскольку в исследовании выявляется генетический материал вируса, то исследование информативно на ранних сроках заболевания в отличие от определения уровня антител в крови.